Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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