Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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