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| PTPRR | Q15256 | MAK-203 | ENST00000474039 | 3859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | DNAAF4-CCPG1-201 | ENST00000565113 | 4589 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | ZNF468-203 | ENST00000595646 | 4407 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTPRR | Q15256 | ANO6-205 | ENST00000441606 | 5955 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | IPO11-203 | ENST00000409534 | 1725 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
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| PTPRR | Q15256 | AC011477.1-204 | ENST00000623416 | 1325 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | LINC01933-204 | ENST00000524295 | 3591 nt | TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | CKAP5-210 | ENST00000529230 | 7121 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | ELAVL2-202 | ENST00000380110 | 3691 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | AGO3-203 | ENST00000373191 | 19687 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | CASC19-201 | ENST00000500112 | 5735 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | DOCK10-202 | ENST00000409592 | 7288 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | PRG4-206 | ENST00000635041 | 4915 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | PWRN2-202 | ENST00000567246 | 4295 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | UBE3A-203 | ENST00000428984 | 2986 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | TJP1-202 | ENST00000356107 | 6747 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | ADGRL2-206 | ENST00000370721 | 5023 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | AC004982.1-201 | ENST00000608770 | 1655 nt | TSL 4 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | PCDH15-217 | ENST00000414778 | 9234 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | PCDH15-227 | ENST00000614895 | 9249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | FABP4-201 | ENST00000256104 | 941 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | IL1RAPL2-201 | ENST00000344799 | 1290 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | IVNS1ABP-201 | ENST00000367497 | 746 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | SPANXN4-201 | ENST00000370504 | 560 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | RNU6-517P-201 | ENST00000384362 | 110 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | Y_RNA.517-201 | ENST00000384551 | 106 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | TRAV23DV6-201 | ENST00000390451 | 409 nt | APPRIS P1 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | RPL7P8-201 | ENST00000411964 | 730 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | MTCO1P54-201 | ENST00000430139 | 712 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | AL354863.1-202 | ENST00000431695 | 494 nt | TSL 5 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| PTPRR | Q15256 | AL590103.1-201 | ENST00000434488 | 307 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |