Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CHD4Q14839 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHD4Q14839 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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