Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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