Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms