Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CENPFP49454 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CENPFP49454 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms