Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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