Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28O15084 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms