Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM47Q96LD4 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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