Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CHD4Q14839 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CHD4Q14839 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CHD4Q14839 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CHD4Q14839 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CHD4Q14839 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CHD4Q14839 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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