Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms