Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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