Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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TCOF1Q13428 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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TCOF1Q13428 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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TCOF1Q13428 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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