Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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