Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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