Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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