Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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