Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCZQ96LD1 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms