Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
AP5B1Q2VPB7 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms