Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CCDC142Q17RM4 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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