Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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