Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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IFT88Q13099 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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IFT88Q13099 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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IFT88Q13099 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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IFT88Q13099 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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IFT88Q13099 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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IFT88Q13099 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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IFT88Q13099 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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IFT88Q13099 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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IFT88Q13099 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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