Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
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