Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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