Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms