Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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