Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTL8BQ17RB0 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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