Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms