Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ARHGEF6Q15052 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms