Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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