Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.28□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SRSF5Q13243 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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