Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA13P31271 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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