Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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PTPRCP08575 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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PTPRCP08575 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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PTPRCP08575 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRCP08575 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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