Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP35Q9P2H5 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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