Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CNTN3Q9P232 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNTN3Q9P232 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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