Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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