Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290 ms