Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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RYR3Q15413 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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