Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms