Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ZNF30-206ENST00000601957 2583 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 GCNT1-201ENST00000376730 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ARSF-202ENST00000381127 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PNPLA8-201ENST00000257694 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 C9orf43-201ENST00000288462 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 KIF13B-201ENST00000521515 2765 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ZNF860-201ENST00000360311 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 STIP1P3-201ENST00000394563 1624 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AL353072.1-201ENST00000446021 442 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RPSAP55-201ENST00000477347 876 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 C3P1-201ENST00000495140 3526 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ACSL6-212ENST00000431707 2060 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 TMEM254-205ENST00000372281 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 SYT14-202ENST00000367019 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CXorf36-202ENST00000398000 4655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 ZNF195-205ENST00000399602 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RAB36-201ENST00000263116 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 LINC01588-217ENST00000635379 1595 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 NELL1-203ENST00000357134 3022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MAPK10-295ENST00000641274 2259 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 MAPK10-301ENST00000641313 2482 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
HOXD11P31277 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms