Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
C4BP0C0L5 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms