Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RBM42Q9BTD8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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