Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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