Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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