| RUNX3 | Q13761 | LINC02466-202 | ENST00000509105 | 653 nt | TSL 3 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FABP5P6-201 | ENST00000510588 | 409 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC106864.1-201 | ENST00000510655 | 640 nt | TSL 3 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01969-201 | ENST00000514468 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112206.4-201 | ENST00000515142 | 405 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF117829.1-209 | ENST00000523995 | 767 nt | TSL 2 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTS-202 | ENST00000524931 | 696 nt | TSL 3 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DDHD2-219 | ENST00000529845 | 945 nt | TSL 5 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4R2P-201 | ENST00000530815 | 597 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02326-201 | ENST00000552028 | 540 nt | TSL 3 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027176.2-201 | ENST00000559166 | 746 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ZNF66-203 | ENST00000594534 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124856.1-201 | ENST00000600819 | 896 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133247.2-201 | ENST00000603236 | 482 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL159169.2-201 | ENST00000610061 | 1269 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP001005.3-201 | ENST00000622049 | 129 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC039056.2-201 | ENST00000622261 | 511 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | CR392039.5-201 | ENST00000623201 | 510 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02109-206 | ENST00000629527 | 854 nt | TSL 5 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OBSCN-204 | ENST00000366707 | 26772 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN1A-202 | ENST00000375405 | 8097 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LGI1-210 | ENST00000629035 | 2251 nt | TSL 5 BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RWDD2B-207 | ENST00000493196 | 3094 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MPDZ-211 | ENST00000536827 | 6176 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01733-201 | ENST00000449316 | 4604 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MANEA-201 | ENST00000358812 | 4575 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABCA6-206 | ENST00000590645 | 1511 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1P42-201 | ENST00000613436 | 1331 nt | BASIC | 4.21 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTCD2-202 | ENST00000380639 | 11151 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THOC1-219 | ENST00000616322 | 2078 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RACGAP1-202 | ENST00000427314 | 3229 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUPT16HP1-201 | ENST00000537175 | 3133 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245100.2-201 | ENST00000454544 | 1679 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC2A3P1-201 | ENST00000519666 | 1451 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z82217.1-201 | ENST00000625157 | 8149 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512283.1-201 | ENST00000606756 | 1384 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | TRAV9-2-201 | ENST00000390441 | 394 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133343.3-201 | ENST00000413983 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GCA-203 | ENST00000429691 | 824 nt | TSL 3 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018644.1-201 | ENST00000429934 | 551 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074367.1-201 | ENST00000438685 | 1125 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355601.1-201 | ENST00000444701 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157884.3-201 | ENST00000448273 | 1184 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND6P32-201 | ENST00000457611 | 483 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF2S2P5-201 | ENST00000457635 | 968 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090543.1-201 | ENST00000492168 | 485 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108210.1-201 | ENST00000510772 | 825 nt | TSL 3 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-889P-201 | ENST00000517189 | 103 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HDAC2-AS2-209 | ENST00000519270 | 1244 nt | TSL 4 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPT1-AS1-216 | ENST00000522845 | 403 nt | TSL 3 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC046130.2-201 | ENST00000537655 | 794 nt | TSL 3 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027544.2-201 | ENST00000539313 | 630 nt | TSL 5 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010601.1-202 | ENST00000567304 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC008759.1-201 | ENST00000589783 | 983 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112230.1-201 | ENST00000604342 | 547 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC144521.1-201 | ENST00000607148 | 956 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00458-206 | ENST00000607494 | 849 nt | TSL 3 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024933.1-201 | ENST00000608472 | 348 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC135803.1-201 | ENST00000608748 | 565 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MILR1-203 | ENST00000615220 | 1196 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121890.2-201 | ENST00000617644 | 465 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015722.2-201 | ENST00000622210 | 551 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354798.1-201 | ENST00000622505 | 329 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015871.5-202 | ENST00000623252 | 701 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP006248.3-201 | ENST00000623580 | 594 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079298.2-201 | ENST00000623885 | 459 nt | BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CSNK1G3-210 | ENST00000521364 | 2580 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGEF38-202 | ENST00000420470 | 5454 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IQCH-206 | ENST00000546225 | 3112 nt | TSL 5 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP1R9A-202 | ENST00000340694 | 9689 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MED12L-201 | ENST00000273432 | 6401 nt | TSL 2 BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHEX-201 | ENST00000379374 | 6172 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.2 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAP3K21-201 | ENST00000366622 | 4005 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBMS1-203 | ENST00000409075 | 1550 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNTN1-201 | ENST00000347616 | 5507 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NFAT5-203 | ENST00000393742 | 13067 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD51.1-201 | ENST00000365405 | 77 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR13C3-201 | ENST00000374781 | 1108 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL672167.2-201 | ENST00000377164 | 879 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-213P-201 | ENST00000384051 | 104 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD96B-201 | ENST00000386148 | 79 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDKL4-202 | ENST00000395035 | 1140 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLEC7A-206 | ENST00000396484 | 1000 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590704.1-201 | ENST00000402856 | 794 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00161-201 | ENST00000412526 | 870 nt | TSL 2 BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006946.1-201 | ENST00000429106 | 328 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590999.1-204 | ENST00000430595 | 638 nt | TSL 3 BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM53B-AS1-201 | ENST00000432699 | 558 nt | TSL 2 BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035246.1-201 | ENST00000433554 | 1255 nt | BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01878-201 | ENST00000434559 | 769 nt | TSL 3 BASIC | 4.19 | □□□□□ -1.74 | | |