Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PICALMQ13492 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PICALMQ13492 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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