Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms