Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRMP28827 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTPRMP28827 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTPRMP28827 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTPRMP28827 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PTPRMP28827 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PTPRMP28827 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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