Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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